Desde su creación, SEKN ha focalizado su modelo de generación y difusión de conocimiento en la creación de alianzas con diversas organizaciones. En su primera etapa, la fundación AVINA fue el principal socio estratégico de SEKN. Adicionalmente, la red ha contado con el apoyo de diversas empresas, entre ellas FEMSA, CEMEX, La Fundación Bancaria LA CAIXA y el Grupo BBVA. Para el año 2017, SEKN cuenta con un número significativo de aliados entre los cuales se encuentran el Observatorio SCALA gestionado por la Facultad de Administración de la Universidad de Los Andes, que cuenta con el apoyo del Banco Interamericano de Desarrollo (BID) y el Fondo Multilateral de Inversiones (FOMIN), el International Development Research Centre (IDRC) y Citibank; Sistema B y Cladea Balas Case Consortium (CBCC).
